一、內設機構

辦公室、人事股、法規與行政審批股、農村政策改革與合作經濟指導股、發展規劃股、計劃財務股、鄉村產業發展股、社會事業促進股、科技教育股（縣農業轉基因生物安全管理辦公室）、綜合信息股、農業資源保護與利用股、農產品質量安全監管股、種植業管理股（農藥管理股）、畜牧業管理股、獸醫管理股、漁業漁政管理股、農業機械化管理股、農田建設與農墾股、蔬菜管理股。

二、所屬事業單位

衡山縣農機事務中心、衡山縣畜牧水產事務中心、衡山縣農村能源服務中心、衡山縣農村經營服務中心、衡山縣農產品質量安全檢驗監測中心、衡山縣農業綜合行政執法大隊、衡山縣農業技術推廣中心、衡山縣農村科技教育培訓中心、衡山縣農田建設事務中心、衡山縣農業綜合服務站、衡山縣貫塘茶場。